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Synthetic Biology, Computer Science or Software Engineering?

This is definitely a tough call, when it comes to the career decision. Computer and programming is my life, I cannot live without it. But synthetic biology looks so fu*cking beautiful, funny and fantastic, it successfully convinced me that this will surely be an amazing industry in the future, just like the IT industry we [...]

Synthetic Biology Conference

前两天参加了在歌德堡举办的Synthetic Biology Conference,受到的启发颇多。其中一个是Chris Voigt设计的Toy System。利用现有的从Systems Biology和Bioinformatics的知识,用DNA sequence为细胞编程,然后设计出符合自己需要的细胞。在Slides上他给我们展示了设计时用的流程图,通过一系列与,非操作使不同的输入获得一定的输出。 Chris利用一组对光信号敏感的DNA sequence作为输入模块,然后一个输出墨渍的DNA sequences作为输出模块。通过特定的组合,把他们引入一种bacteria中,然后把一张照片投影到在培养基上面,他们得到了一张照片的拷贝。而且整个过程是同步完成的,不像打印机那样从上到下输出,耗能也是非常小~~ 然后Chris又给我们展示了另外一组复杂一点的实验,通过一组逻辑判断的组合,可以让bacteria判断它是否在Bright Area和Dark Area的边缘,然后决定是否输出~~(当然不是因为bacteria有脑子,这些是利用某些DNA在特定条件下才会表达的机理,就像只有在离子浓度高的环境里DNA中决定细胞收缩的基因才会自动表达)然后他们得到了一种可以检测实现photoshop里的铜版操作的细胞。 实际工作没有说的这么简单,要找到合适的基因,要找到合适的载体,要找到合适的引入方式,要确定引入的基因不会互相影响。目前好像还不能引入太多的基因。在做以前还要利用Systems Biology对各种细胞做的models先在电脑里做设计。我认为Synthetic Biology是未来20年内的发展方向。在制药,医疗,能源几乎所有的领域都有影响。 在会上Christ 还介绍了一组储存的基因,不过他说的没听清,好像是利用某些基因在特定条件下会翻转,然后这样信息就被储存在基因里。就像2进制是利用0,1一样,不过基因的组合可比二进制多~ 挺令人兴奋的,不是吗?呵呵